由于水利工程檢測機構(gòu)工作人員的文化素養(yǎng)不夠，其管理概念相對落后，不能充分認知到工程檢測管理對于提高水利工程質(zhì)量的重要性，依舊將管理標準定位在工程的施工時間以及對成本的控制層面上，從而忽略了提高施工效率及工程質(zhì)量的重要性，使得基礎(chǔ)理論和工作經(jīng)驗不匹配，不能實現(xiàn)多元化的水利工程建設(shè)。
甘肅省水利工程檢測協(xié)會認為，由于水利工程工作性質(zhì)的特殊性，主要承擔擋水、儲水及泄水的工作任務(wù)，施工過程非常錯綜復(fù)雜，如果水利工程檢測管理不到位，出現(xiàn)其中一個環(huán)節(jié)的錯漏，就會直接威脅到施工單位的經(jīng)濟利益及人民群眾的生命和財產(chǎn)安全。
水利工程檢測管理制度是否完善決定水利工程項目的質(zhì)量能否得以保障，水利工程檢測管理制度不健全，則會導(dǎo)致考核制度不科學(xué)、不合理，無法對員工進行有效的考核及對成本的把控，更無法判斷對工程質(zhì)量的檢測是否落實到位，同時，對施工的安全及進度沒有完全的掌控性，隨意性太強。
蘭州水利工程檢測公司人員的專業(yè)素養(yǎng)對工程檢測工作是否順利起著關(guān)鍵性作用，由于工作人員對水利工程檢測的認知度不夠，缺乏專業(yè)檢測技術(shù)，更因為投入相關(guān)資金有限，致使檢測設(shè)備不齊全，加之檢測的環(huán)境比較復(fù)雜，大大降低了工程檢測能力。
當前水利工程檢測市場競爭激烈并無系統(tǒng)有效的監(jiān)管，主管的相關(guān)部門也只是按一定比例抽查，致使很多檢測單位為了經(jīng)濟效益仍存在僥幸心理，導(dǎo)致檢測工作不規(guī)范嚴謹、檢測結(jié)果不能真實反映施工質(zhì)量的真實情況。
目前大多數(shù)水利工程檢測市場已經(jīng)開始自立門戶，不再受政府部門的監(jiān)管，但是由于其內(nèi)部管理機制不健全，檢測水平停滯不前，檢測不規(guī)范，甚至以低價擾亂市場風(fēng)氣，近年來，水利工程質(zhì)量頻頻發(fā)生的安全問題值得引人思索。因為水利工程檢測監(jiān)管不到位，使得水利工程設(shè)施整體的穩(wěn)固性及其安全性受到了嚴重的影響，將給水利工程的質(zhì)量帶來無窮的隱患。因此，隨著水利工程建設(shè)不斷地發(fā)展，要想水利工程檢測市場保持持久性的發(fā)展，機制改革是水利工程檢測市場面對的重要挑戰(zhàn)。